Des aliens appelés Virans essayent de conquérir la Terre. Gamera déjoue leur première attaque, en détruisant le vaisseau spatial des Virans. Cependant, la deuxième fois, les Virans prennent le contrôle de Gamera, l'envoyant détruire Tokyo. Ils enlèvent aussi deux enfants, Jim et Masao....
Yukiko Eguchi quitte Tokyo et retourne dans la ville d'où est originaire son père pour y faire porter ses cendres. Sur place, elle est hébergée par le clan Gunji. Yukiko découvre que le clan est en proie à des difficultés, Kōichi le fils du boss est ingénieur en aquaculture et ne veut rien...
